Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie (IZSVe)
Ente sanitario di prevenzione, ricerca e servizi per la salute animale e la sicurezza alimentare
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Ecologia microbica

Ecologia microbica

L’ecologia microbica è la scienza che studia come i microrganismi interagiscono tra loro, con l’ambiente e con gli ospiti. Tali interazioni sono determinanti per la salute umana e animale, e possono essere esplorate:

  • al livello di singola specie (o sottospecie) batterica, al fine di comprendere i meccanismi di virulenza, persistenza, resistenza e patogenicità di interesse per la salute pubblica;
  • al livello di comunità microbica nella sua complessità di composizione, interazione e funzione.

Sono quindi argomenti dell’ecologia microbica:

  • la comprensione della composizione tassonomica e genetica e dell’attività delle comunità microbiche complesse umane, animali e alimentari, altrimenti noto come studio del microbiota e del microbioma, al fine di acquisire informazioni preziose sui complessi ecosistemi formati da queste comunità in risposta alla pressione selettiva dell’ambiente;
  • la comprensione dei fattori che determinano la diversità dei microrganismi patogeni a trasmissione alimentare e della dinamica della loro interazione con l’ambiente;
  • lo studio della risposta e dell’adattamento dei microrganismi patogeni a stimoli ambientali biotici e abiotici, inclusi gli antibiotici e i biocidi.

Attività IZSVe

L’U.O. Ecologia microbica dell’Istituto Zooprofilattico Sperimentale delle Venezie si occupa di:

  • ecologia dei microrganismi in ambienti naturali e sperimentali;
  • analisi di genomica comparativa su batteri patogeni a trasmissione alimentare;
  • metatassonomica e metagenomica batterica;
  • messa a punto di metodiche molecolari avanzate per lo studio delle interazioni tra microrganismi, della diversità microbica e della filogenia;
  • studi ecologici delle malattie causate da batteri;
  • studi ecologici dell’impatto dei contaminanti (antibiotici, metalli pesanti, nanomateriali, etc.) sulle comunità microbiche residenti in matrici complesse (ambiente, animali e alimenti).

Referente IZSVe

Carmen Losasso
SCS1 – Analisi del rischio e sorveglianza in sanità pubblica
U.O. Ecologia microbica
+39 049 8084169 | closasso@izsvenezie.it
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Pubblicazioni

  • Petrin S. , Longo A., Barco L., Cortini E., Peruzzo A., Antonelli P., Ramon E., Cibin V., Lettini A A, Ricci A. and Losasso C. (2019). Different Resolution Power of Multilocus Variable-Number Tandem Repeats Analysis (MLVA) and Whole Genome Sequencing (WGS) in the Characterization of S. 1,4,[5],12:i:- Isolates. Foodborne pathogens and diseases, in press
  • Biancotto G., Bovo D., Mastrorilli E., Manuali E., Angeletti R., Stella R. (2019). TMT-based proteomics profiling of bovine liver underscores protein markers of anabolic treatments. Proteomics, in press
  • Cibin V., Busetti M., Longo A. , Petrin S., Knezevich A., Ricci A., Barco L., Losasso C. (2019). Whole genome sequencing of Salmonella serovar Stanleyville from two Italian outbreaks resulted in unexpected genomic diversity within and between outbreaks. Foodborne pathogens and diseases, 16, doi.org/10.1089/fpd.2018.256
  • Losasso C., Di Cesare A., Mastrorilli E., Patuzzi I., Cibin V., Eckert EM, Fontaneto D., Vanzo A., Ricci A., Corno G. (2018). Assessing antibiotic resistance gene load in vegan, vegetarian and omnivore human gut microbiota. Journal of Antimicrobial Agents, 52(5):702-705. doi: 10.1016/j.ijantimicag.2018.07.023
  • Di Cesare A., Petrin S., Fontaneto D., Losasso C., Eckert EM,, Tassistro G., Borello A., Ricci A., Wilson WH, Pruzzo C., Vezzulli L. (2018). ddPCR applied on archived Continuous Plankton Recorder samples reveals long‐term occurrence of class 1 integrons and a sulphonamide resistance gene in marine plankton communities. Environmental microbiology reports,10(4):458-464. doi: 10.1111/1758-2229.12665
  • Mastrorilli E., Pietrucci D., Barco L., Ammendola S., Petrin S., Longo A., Mantovani C., Battistoni A., Ricci A., Desideri A and Losasso C. (2018). A comparative genomic analysis provides novel insights into the ecological success of the monophasic Salmonella serovar 4,[5],12:i:-, Frontiers in microbiology, 9:715. doi: 10.3389/fmicb.2018.00715
  • Losasso C., Eckert E., Mastrorilli M., Villiger J., Mancin M., Patuzzi I., Di Cesare A., Cibin V., Barrucci F., Pernthaler J., Corno G. and Ricci A. (2018). Assessing the influence of vegan, vegetarian and omnivore oriented westernized dietary styles on human gut microbiota: a cross sectional study. Frontiers in microbiology 9:317. doi: 10.3389/fmicb.2018.00317. eCollection 2018:317
  • Ravagnan, S., Tomassone, L., Montarsi, F., Krawczyk, A. I., Mastrorilli, E., Sprong, & Capelli, G. (2018). First detection of Borrelia miyamotoi in Ixodes ricinus ticks from northern Italy. Parasites & vectors, 11(1), 130.
  • Stella, R., Dervilly-Pinel, G., Bovo, D., Mastrorilli, E., Royer, A. L., Angeletti, R., … & Biancotto, G. (2017). Metabolomics analysis of liver reveals profile disruption in bovines upon steroid treatment. Metabolomics, 13(7), 80.
  • Conficoni D, Losasso C, Cortini E, Di Cesare A, Cibin V, Giaccone V, Corno G, Ricci A. (2016). Resistance to biocides in Listeria monocytogenes collected in meat-processing environments  Frontiers in microbiology, 7
  • Di Cesare A., Losasso C., Barco L., Eckert EM., Conficoni D., Sarasini G., Corno G., Ricci A. (2016). Diverse distribution of Toxin-Antitoxin II systems in Salmonella enterica serovars. Scientific Reports, 6
  • Belluco S., Losasso C., Patuzzi I., Rigo L., Conficoni D., Galloccho F., Cibin V., Catellani P., Segato S., Ricci A. (2016). Silver as antibacterial toward Listeria monocytogenes. Frontiers in microbiology, 7
  • Losasso C. , Belluco S. , Cibin V., Zavagnin P., Mičetić I., Gallocchio F., Zanella M., Bregoli L., Biancotto G., Ricci A. (2014). Antibacterial activity of silver nanoparticles: sensitivity of different Salmonella serovars. Frontiers in microbiology, 5

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